В связи с участием казахстанских клубов в европейских клубных турнирах сезона 2009/2010 в календарь футбольного сезона-2009 внесены изменения. Календарь оставшихся матчей чемпионата и Кубка Казахстана выглядит следующим образом:  

22 тур
14 сентября (понедельник)
148. Локомотив – Иртыш
149. Тобол – Атырау
150. Казахмыс – Ордабасы
151. Актобе – Восток
152. Жетысу – Окжетпес
153. Шахтер – Кызылжар
154. Кайсар – Тараз

17 сентября (четверг)
Кубок Казахстана 1/4 финала, первый матч
Актобе - Восток

23 тур
20 сентября (воскресенье)
155. Тараз – Казахмыс
156. Окжетпес – Шахтер
157. Иртыш – Кайсар
159. Кызылжар – Тобол
161. Атырау – Локомотив

21 сентября (понедельник)
158. Ордабасы – Актобе

22 сентября (вторник)
160. Восток – Жетысу

25 сентября (пятница)
104. Актобе – Локомотив (матч 15 тура)

24 тур
27 сентября (воскресенье)
162. Кайсар – Казахмыс
163. Ордабасы – Шахтер
165. Окжетпес – Атырау
166. Восток – Тобол
167. Тараз – Жетысу

29 сентября (вторник)
164. Иртыш – Актобе
168. Кызылжар – Локомотив

3 октября (суббота)
106. Актобе – Жетысу (матч 16 тура)

3 октября (суббота)
Кубок Казахстана 1/4 финала, первый матч
Кайсар – Атырау

4-15 октября
тренировочный сбор национальной сборной Казахстана

10 октября (суббота)
отборочный турнир чемпионата мира 2010
Беларусь – Казахстан

11 октября (воскресенье)
отборочный турнир чемпионата Европы 2009 – 2011
среди молодежных команд
Казахстан – Швеция

14 октября (среда)
отборочный турнир чемпионата мира 2010
Казахстан – Хорватия

14 октября (среда)
отборочный турнир чемпионата Европы 2009 – 2011
среди молодежных команд
Черногория – Казахстан

18 октября (воскресенье)
Кубок Казахстана 1/4 финала, ответные матчи
Атырау – Кайсар
Жетысу – Тараз
Восток - Актобе
Шахтер - Иртыш

22 октября (четверг)
113. Шахтер – Актобе (матч 17 тура)

25 тур
25 октября (воскресенье)
169. Локомотив – Кайсар
170. Казахмыс – Иртыш
171. Жетысу – Ордабасы
173. Тобол – Окжетпес
174. Атырау – Кызылжар
175. Актобе – Тараз

26 октября (понедельник)

172. Шахтер – Восток

29 октября (пятница)
122. Актобе – Тобол (матч 18 тура)

26 тур
2 ноября (понедельник)
176. Локомотив – Казахмыс
177. Актобе – Кайсар
178. Жетысу – Иртыш
179. Тобол – Ордабасы
180. Атырау – Восток
181. Кызылжар – Окжетпес
182. Шахтер – Тараз

7 ноября (суббота)
Кубок Казахстана 1/2 финала, первые матчи

11 ноября (среда)
Кубок Казахстана 1/2 финала, ответные матчи

15 ноября (воскресенье)
Кубок Казахстана
финал